Le enterotossiemie si osservano frequentemente negli agnelli quando le pecore non sono state vaccinate contro le tossinfezioni da clostridi o in occasione di bruschi cambiamenti di alimentazione. Negli allevamenti di ovini da carne, il sistema di produzione tradizionale espone gli animali a una grave pressione parassitaria. Il controllo del parassitismo interno è fondamentale per la prevenzione delle entertossiemie. Gli agnelli al pascolo sono colpiti soprattutto da teniasi, strongilosi gastrointestinale e haemonchosi; gli agnelli in ovile dalla coccidiosi. Le malattie respiratorie, soprattutto le pasteurellosi, sono altrettanto frequenti. Infine, numerose affezioni nutrizionali si manifestano alcune condizioni di allevamento: acidosi ruminale, pica o litiasi urinarie.
La valutazione dell’efficacia delle attività di controllo ufficiale svolte dalle Autorità competenti dovrebbe essere regolarmente condotta al fine di verificare l’effettiva garanzia dei Livelli Essenziali di Assistenza, di cui i controlli ufficiali per la sicurezza alimentare fanno parte, e di razionalizzare l'utilizzo delle risorse